NF­DI4­Bio­Di­ver­si­ty

Ver­knüp­fung bio­lo­gi­scher Da­ten im Rah­men von NF­DI4­Bio­di­ver­si­tät

49 Partner haben sich zum NFDI4BioDiversity Konsortium zusammengeschlossen, um Datenverfügbarkeit für Umweltanalysen zu verbessern und praktische Software-Werkzeuge bereitzustellen. Das Konsortium ist Teil eines größeren Netzwerks innerhalb der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur (NFDI), die durch ein 10-Jahres-Programm der Gemeinsamen Wissenschaftsministerkonferenz (GWK) gefördert wird. Unsere Aufgabe im Konsortium ist die Nutzeranbindung an das NFDI4BioDiversitäts-Netzwerk, um den Mehrgewinn durch Datenverfügbarkeit exemplarisch aufzuzeigen (TA1-2Involve).

NF­DI4­Bio­Di­ver­si­ty Kon­sor­ti­um Web­site

Pu­bli­ka­tio­nen

Glöckner FO, Diepenbroek M, Felden J, Overmann J, Güntsch A, Stoye J, Overmann J, Wimmers K, Kostadinov I, Yahyapour R, Müller W, Scholz U, Triebel D, Frenzel M, Gemeinholzer B, Goesmann A, König-Ries B, Bonn A, Seeger B (2020): NFDI4BioDiversity - A Consortium for the National Research Data Infrastructure (NFDI), Zenodo, https://doi.org/10.5281/zenodo.3943645

Miralles A, Bruy T, Wolcott K, Scherz MD, Begerow D, Beszteri B, Bonkowski M, Felden J, Gemeinholzer B, Glaw F, Glöckner FO, Hawlitschek O, Kostadinov I, Nattkemper TW, Printzen C, Renz J, Rybalka N, Stadler M, Weibulat T, Wilke T, Renner SS, Vences M (2020): Repositories for Taxonomic Data: Where We Are and What is Missing. Systematic Biology, 2020 Apr 16. pii: syaa026. https://doi.org/10.1093/sysbio/syaa026

Gemeinholzer B, Vences M, Beszteri B, Bruy T, Felden J, Kostadinov I, Miralles A, Nattkemper TW, Printzen C, Renz J, Rybalka N, Schuster T, Weibulat T, Wilke T, Renner SS (2020): Data storage and data re-use in taxonomy – the need for improved storage and accessibility of data other than DNA sequences. Org Divers Evol 20, 1–8 (2020). https://doi.org/10.1007/s13127-019-00428-w

Glöckner FO, Diepenbroek M, Felden J, Overmann, Bonn A, Gemeinholzer B, Güntsch A, König-Ries B, Bonn A, Seeger B;, Pollex-Krüger A, Fluck, J, Pigeot I, Toralf K, Mühlhaus T, Wolf Ch, Heinrich U, Steinbeck Ch, Koepler O, Stegle O, Weiman, J, Schörner-Sadenius T, Gutt, C, Stahl F, Wagemann K, Schrade T, Schmitt R, Eberl C, Gauterin F, Schultz M, Bernard L (2019): Berlin Declaration on NFDI Cross-Cutting Topics, Zenodo,  https://doi.org/10.5281/zenodo.3457213

Gemeinholzer B, Nieschulze J, Tauch A, Goesmann A (2019): Big Data in der Biologie: kein Problem mehr! Biologie in Unserer Zeit (Biuz),49(1), 58-67.

Droege G, Barker K, Seberg O, Coddington J, Benson E, Berendsohn WG, Bunk B, Butler C, Cawsey EM, Deck J, Döring M, Flemons P, Gemeinholzer B, Güntsch A, Hollowell T, Kelbert P, Kostadinov I, Kottmann R, Lawlor RT, Lyal C, Mackenzie-Dodds J, Meyer C, Mulcahy D, Nussbeck SY, O’Tuama É, Orrell T, Petersen G, Robertson T, Söhngen C, Whitacre J, Wieczorek J, Yilmaz P, Zetzsche H, Zhang Y, Zhou X (2016): The Global Genome Biodiversity Network (GGBN) Data Standard specification. Database, 1–11.

Schmidt B, Gemeinholzer B, Treloar A (2016): Open Data in Global Environmental Research: The Belmont Forum's Open Data Survey. PLOS One, https://doi.org/10.1371/journal.pone.0146695

Allison L, Gurney R, Cesar RM, Gemeinholzer B, Koike T, Mathieu PP, Mokrane M, Nativi S, Peters D, Samors B, Treloar AE, Vilotte JP, Visbeck M, Waldmann C (2015): A place to stand: e-Infrastructures and Data Management for Global Change Research, GEOSS Common Infrastructure: The Discovery and Access Broker (DAB) framework. Belmont Forum e-Infrastructures and Data Management Project, https://doi.org/10.5281/zenodo.34370

Coddington J, Barker K, Droege G, Astrin J, Bartels P, Butler C, Cantrill D, Forest F, Gemeinholzer B, Hobern D, Mackenzie-Dodds J, Ó Tuama É, Petersen G, Sanjur O, Schindel D, Seberg O (2014): GGBN: Making genomic collections discoverable for research through a networked community of biodiversity repositories. IN: DNA Banking for the 21st Century, Publisher: The William L. Brown Center at the Missouri Botanical Garden., Editors: Wendy Applequist, Lisa Campbell, pp.165-168.

Amann J, Braus G, Gemeinholzer B, Häuser C, Jahn R, Lohrmann V, Lüter C, Meyer A, Misof B, Raupach MJ, Renner SS, Roos C, Rossello-Mora R, Schleifer KH, Steinicke H, Suerbaum S, Vences M, Vogel J, Wägele W (2014): Herausforderungen und Chancen der integrativen Taxonomie fuer Forschung und Gesellschaft - Taxonomische Forschung im Zeitalter der -OMICS-Technologien; Challenges and Opportunities of Integrative Taxonomy for Research and Society Taxonomic Research in the Era of -OMICS Technologies, Deutsche Akademie der Naturforscher Leopoldina e.V.

Droege G, Barker K, Astrin JJ, Bartels P, Butler C, Cantrill D, Coddington J, Forest F, Gemeinholzer B, Hobern D, Mackenzie-Dodds J, Tuama E, Petersen G, Sanjur O, Schindel D, Seberg O (2013): The Global Genome Biodiversity Network (GGBN) Data Portal, Nucleic Acids Research.

Marquard E, Dauber J, Doerpinghaus A, Dröschmeister R, Frommer J, Frommolt KH, Gemeinholzer B, Henle K, Hillebrand H, Kleinschmit B, Klotz S, Kraft D, Premke-Krauss M, Römbke J, Vohland K, Wägele W (2013): Biodiversitätsmonitoring in Deutschland: Herausforderungen für Wissenschaft, Politik und Umsetzung, Naturschutz und Landschaft 8(88): 337-341.